Когато работи на сухо, диафрагмената помпа няма да прегрее – няма повърхности, които да се трият една в друга, причинявайки прекомерно генериране на топлина. Също така, кавитацията не е толкова разрушителна, колкото в случая с центробежните помпи. Въпреки това, не се препоръчва да работите на сухо постоянно или за дълги периоди.
Работата на сухо е непродуктивна и скъпа. При работа на сухо мембранната помпа може да работи от два до три пъти по-бързо, отколкото при натоварване. Това ще доведе до по-голям разход на въздух (разходи за електричество) и непродуктивна консумация на цикли на диафрагмите. Поради повишената скорост на помпата по време на работа на сухо, диафрагмите ще направят много „празни“ ходове, намалявайки собствената си еластичност (способност да се връщат в първоначалната си форма, след като е била разтегната), което води до скъсяване на живота.
В случай на тефлонови мембраи, бързото намаляване на еластичността може да доведе до сериозни последствия, защото не са толкова устойчиви на работа на сухо, колкото диафрагмите, изработени от други материали. Недостатък на тефлоновите мембрани е устойчивостта. Също така тефлоновата мембрана нямат „памет“, не е в състояние да се върне в първоначалната си форма след деформация.